目前電子稅務局無法全流程申請手續費返還,可以在“電子稅務局首頁 ——我要辦稅 —— 其他服務事項——三代手續費—— 代征代扣稅款結報單”打印《代征代扣稅款結報單》和《代扣代收和代征稅款手續費領款單》并加蓋公章,向主管稅務機關提交上述資料申請手續費返還。