ITS系統扣繳客戶端支持銀行端查詢繳稅和個人三方協議繳稅(目前不支持使用被投資單位的三方協議繳稅),自然人辦稅服務平臺支持銀聯卡在線支付和個人三方協議繳稅。如需通過個人三方協議繳稅,經營所得納稅人本人可在登錄自然人辦稅服務平臺后,鏈接到“深圳本地業務”,網上簽訂個人三方協議。