深圳自然人在微信代開發票的金額限制如下:
(1)自然人通過微信申請代開發票,連續12個月內代開普通發票的不含稅銷售額未達到80萬元的允許繼續在微信申請代開,達到后代開發票應在辦稅服務廳辦理;
(2)自然人通過微信申請代開發票,連續12個月內免稅代開(單日不含稅銷售額不超過500元情形)次數未達到12次的允許繼續在微信申請代開,達到后免稅代開發票應在辦稅服務廳辦理。